Wine має своє програмне забезпечення, яке нагадує MS Windows лише зовні, але не містить жодного шматка коду, що співпадає з Windows. І в тому числі Wine автоматично не імпортує з MS Windows жодних даних - ні реєстру, ані налаштувань. Це середовище для запуску Windows-програм, - не більше, і не менше.